为了让广大知友了解现有的关于情绪和音乐研究的发展进程，对于理解音乐和情绪的关系，我这里从音乐美学和心理学和生理学等角度，从已有的研究基础来看待这个问题。
首先来看一下关于对于音乐和情绪的研究，在不同领域中不同的观点
·音乐美学领域在音乐美学中有这样两大派别 他律论和自律论他律论：认为音乐和其他艺术形式一样，都是一种人类表达情感或者思想的工具或者媒介，音乐也要表达音乐以外的人类的情感和思想。自律论：认为音乐所表现的内容就是音乐本身，它不表现，也无法表现音乐以外的任何东西，如情绪情感、思想理念、故事情节或自然体验。
·心理学领域美国学者扬（Yung,1961）提出，情绪一种对正常生理、心理平衡的扰乱和破坏。”当人被周围情境激动到他的大脑控制减弱或失去控制的时候，这个人就有了情绪“海曼(Hohmann,1962)则提出，情绪是一种生理激活和生理能量的动员。情绪是对正常过程的破坏和中断。这种理论对于那些激烈的情绪，如和愤怒、兴奋、恐惧、快乐等是恰当科学的，但不足够解释那些较低生理唤醒水平的情绪，如舒适、惆怅、迷茫、满足。同时也把美感排除在了情绪研究之外。在20世纪60年代后，美国著名心理学家汤姆金斯和依扎德从婴幼儿情绪研究入手，对情绪的生物功能，及情绪在人类的人格和认知结构形成中的作用进行了大量观察研究，提出了情绪的动机理论。”第一性的动机体系就是情感体系，生物的内驱力（由生物性需要形成的动机）只有经过情感体系的放大才具有动机的作用。“
下面来用音乐的几个特性从生理学和音乐声学的角度来解释大脑对于不同音乐要素变化所引起的反应，相信足够回答题主的问题
·和声乐器发出的每一个音都是一个单纯的正弦波的基音之上的许多谐波（也就是泛音）共同构成的。谐波的数量以及谐波在音列中的排列方式取决于乐器的材料质量，不同数量的谐波的组合方式决定了乐器的音色。假设一只长号吹出的C音含有6个可被听觉察觉到的谐波，那么内耳的基底膜上产生的振动点就有7个，产生的电信号也就会有7簇。那么三只长号吹出的C大三和弦（CEG）就会在基底膜产生14个振动点并产生14簇电信号。如果演奏出一个减七和弦（BDF）就在基底膜会产生19个振动点，并产生19簇电信号。
协和和弦产生神经纤维放电密度较不协和和弦小，神经纤维放电密度随着和弦不和谐程度增加而增加。由于更多的泛音和正弦波和谐波的频率不协调产生的不规则振动的噪音，神经纤维放电数量会急剧增加。
当然，和谐与不和谐也是相对的，比如大三和弦进入减七和弦，会让人产生吃惊和恐惧的情绪体验，如果由一个小二度关系构成的和弦解决到减七和弦上，造成的感觉又类似减七和弦解决到大三和弦的体验。
C大三和弦 1 3 5 C减七和弦 1 3b 5b 7bb 大家如果有钢琴的可以自己弹着试试
·力度一个较强的乐音信号，或者说一个较强的振幅的液压波所触发的毛细胞的数量要多于一个振幅较小的液压波，因此释放出来的动作电位的数量也要多一些，反映到下丘脑中的放电密度也要大一些。这样，振幅大小的关系就转换成了动作电位的数量关系。由于神经纤维放电密度的变化，突然增强的乐音力度会在下丘脑中的情绪模式中转换为吃惊的情绪反应；稍慢一点的力度增强会在下丘脑中转换为紧张的情绪反应；乐音力度的平稳增强会造成情绪反应的加强和高涨；乐音力度的减弱会造成愉快的、或是趋于平静的情绪反应等等。
·节奏前面已经提到，乐音符号的强弱关系到达下丘脑时，已经变为电脉冲的动作电位的数量关系。那么2/4拍的乐音组织关系就是 强--弱--强--弱，相对应的电位密度就是 多--少--多--少 的关系，也就形成了情绪反应的 强--弱--强--弱 的关系。由于下丘脑不仅是情绪整合的中枢，也是动机形成的中枢，因此当动作电位数量以多寡悬殊的比例有规律的变化时，下丘脑所产生的情绪性的起伏反应会沿着下行的传导神经纤维向机体的外周和内脏扩散，引起机体各部骨骼肌肉动作的行为动机。这时，人的外部动作行为本身就是情绪性的，或者说是情绪的外部表达形式。
·旋律和声、力度和节奏等因素在生理反应模式中本身具有先天的、生物程序的情绪功能，而旋律不同，它不具有先天的生理的情绪性质，它被整合的中枢部位是在大脑皮层，他的全部意义都依赖于大脑皮层的认知和评估作用。来自听觉神经的音高组织信号被传导到大脑。不同的音高产生不同的神经纤维输送到大脑皮层的不同部位，形成不同的音高体验。现代神经心理学研究已经证明，携带不同频率声音信号的神经纤维终止与大脑皮层的听觉中枢的不同部位。听觉中枢位于被称为”薛氏窝“的深沟中，高频信号终止在薛氏窝的深部，而低频音终止在外表面附件。同一条旋律可以配上不同甚至相反的意义的歌词，也可以用不同的和声、力度和节奏处理而形成不同的音乐情绪。比如柏辽兹的《幻想交响曲》中爱人的主导动机用不同的手法处理就可以用来表现不同的形象和概念。
一个58岁男性胆囊癌晚期患者（算是临终关怀里非常年轻的病人了）。年轻时是爵士吉他手，也会画画，喜欢艺术。一度嗑药，后来戒了几十年，但他妻子一直嗑药且精神不正常，在街上流浪。他被下诊断书后不让任何人联系他的妻女，孤身一人在养护院度日。有一次探访他，他处在极度抑郁，焦虑，恐惧（死亡）的状态，而且呼吸困难（肺积水和焦虑）。破冰之后，我尝试用轻柔的纯吉他弹奏引导他规律呼吸，但作用不大。然后我试着邀请他弹我的吉他，他试了一下也没有兴趣。最后我实在没辙了，我说那我唱一首我自己写的歌给你听吧。他同意了。歌是用中文写的，我给他翻译了一下歌词然后唱了。这个歌是五声调式写的，旋律简单，和弦不算复杂，流动性比较强。
他听的时候闭上了眼睛，听完以后他笑了（这以前从来没见他笑过），他说"you ask me to breath with the music, it didn't help. then you ask me to play your guitar, didn't help. but you know what, this is exactly what I need to hear."然后，他开始跟我聊他的人生，对他退休生活的原本期许，对上帝的许多疑问，对死亡不期而至的恐惧等等。这个时候，我觉得他之前的抑郁和焦虑暂时被搁置了（注意啊我觉得不是疗愈而是暂时的搁置）。
（题外话－乐曲进行时，我观察他的呼吸监视器，他呼吸的频率慢慢降低了。）
前面大家讲到共鸣，共情，或曰同理心，我很赞同，因为临床上感同身受。提供另外一个角度，借用我朋友的一个说法：音乐是全息的。我觉得任何一件音乐作品都包含，表达，甚至就是创作者当时身，心，灵的全部体验。当这个作品被重新播放或者演奏的时候，就好像那些体验的重现。对于听者来讲，他所接收到的也许是全部的信息。换句话说，音乐承载的信息量比较大，除了二元的，认知的信息以外，还有直觉的，情感的，潜意识的，超越二元的信息。
也许是因为这样，音乐才可以如此强力地影响人的情绪（以及许多其他生理和心理的方面）。也许正因这样，我自己在琢磨到底是哪一个音乐元素影响了脑部的哪一个区域，又是哪一个音乐元素控制着人们什么样的期许这样的问题时，有一种无力感。所以感谢以上各位大师的细究。
总结了对于“音乐如何影响情绪"的一些猜想脑干反射：音乐当中一种或多种声学上的基本特性被脑干捕获，脑干将此识别成一些值得注意的重要或紧急信息。
生理节律与音乐节奏的"共鸣"：人体的一些生理节律（例如心律）在外部的音乐节奏/节拍影响下，和音乐同步。有过live经验的人对此应该有所体会。
评价性条件反射：某些音乐在某个人的经历里总是和或正面或负面的其他刺激同时出现，这个人在听到相应的音乐时就会被引起相应的或正面或负面的情绪（可参考：经典条件反射）。
情绪传染：人感受到音乐所传递的情绪，继而将其内化（可参考：共情）。
视觉想像：这个很容易理解，听到音乐时联想到了一些视觉画面，就引起了和那些视觉画面相联系的情绪。
情节记忆：音乐让人回忆起了关于自身的一些过往经历，引起了和这些经历相关的情绪。
对音乐的期待：在一段音乐的行进当中，无论是符合了还是违反了听者对于音乐的期待，都有可能引起情绪。
以上猜想有部分得到些许证实，目前还需要更多研究去了解音乐影响情绪的机制。
神经科学方面，有不少研究表明听音乐能引起边缘系统的激活，而边缘系统和情绪有极为密切的关系。可以粗略比较下面两幅图，黑白图中的彩色点的分布和彩色图中的红色部分有重合。